检察院撤回起诉后应当作出不起诉决定，但是撤回起诉并不等于就一定没事了。第一，人民法院宣告判决前，人民检察院经检察长批准，可以撤回起诉，对于撤回起诉的案件，应当在撤回起诉后三十日以内作出不起诉决定。第二，撤回起诉的案件，没有新的事实或者新的证据，人民检察院不得再行起诉。但是如果重新调查或者侦查后，发现有犯罪事实的，可以再提起公诉。
法律依据：《人民检察院刑事诉讼规则》第四百二十四条
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